279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2253 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 139 aa  283  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  83.45 
 
 		 139 aa  244  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  85.19 
 
 		 139 aa  239  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  76.87 
 
 		 146 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  81.48 
 
 		 139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  73.88 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.64 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.43 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.44 
 
 		 133 aa  181  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.43 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.93 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.43 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.93 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.93 
 
 		 134 aa  176  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 		 139 aa  167  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  61.19 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.7 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.7 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.96 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.97 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  63.11 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.7 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.72 
 
 		 136 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.4 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.45 
 
 		 136 aa  156  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.96 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  55.8 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.72 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.93 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.65 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.39 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.39 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.64 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.22 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.68 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.02 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.81 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.72 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.37 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.04 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.01 
 
 		 543 aa  94.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.91 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.1 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.51 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.22 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.13 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.82 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.94 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.1 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.75 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.53 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.85 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  40.15 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  39.53 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.43 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.31 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.83 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.06 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.46 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.97 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.62 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.97 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.3 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.73 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>