280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2970 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 146 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  88.41 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  86.86 
 
 		 141 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  83.21 
 
 		 139 aa  236  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  77.21 
 
 		 139 aa  223  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  83.94 
 
 		 139 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  76.87 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  69.4 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.42 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.67 
 
 		 134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.67 
 
 		 134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.93 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.27 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  63.77 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.5 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.42 
 
 		 135 aa  173  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.41 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.76 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.42 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.7 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.39 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  62.22 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  62.04 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.46 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.57 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.57 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.44 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.27 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.87 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  62.81 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.4 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.22 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.65 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.22 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.97 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.14 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.41 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.78 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.75 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.75 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.42 
 
 		 543 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  43.18 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.74 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 		 143 aa  87  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.78 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.78 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.22 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.46 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.38 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.78 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.78 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.78 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.78 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.42 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.1 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.69 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.41 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.91 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.24 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  48.42 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.69 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.72 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.76 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  38.17 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>