279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2638 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
139 aa  277  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  84.17 
 
 
139 aa  243  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  83.94 
 
 
146 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  78.99 
 
 
139 aa  229  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.15 
 
 
139 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  75.54 
 
 
141 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  81.48 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  69.63 
 
 
133 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.67 
 
 
134 aa  180  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.67 
 
 
134 aa  180  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.67 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.5 
 
 
134 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.31 
 
 
139 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.04 
 
 
134 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.43 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.69 
 
 
136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.18 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  60.29 
 
 
140 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.71 
 
 
136 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.65 
 
 
133 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.56 
 
 
133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.7 
 
 
133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  65.57 
 
 
133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 
132 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.15 
 
 
142 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.41 
 
 
137 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.21 
 
 
139 aa  157  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 
139 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 
136 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  61.65 
 
 
134 aa  156  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.9 
 
 
137 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.9 
 
 
137 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.48 
 
 
133 aa  155  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.4 
 
 
142 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  56.12 
 
 
145 aa  150  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.12 
 
 
150 aa  150  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.83 
 
 
136 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.14 
 
 
135 aa  147  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.94 
 
 
135 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
127 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
138 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.1 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 
130 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 
130 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.6 
 
 
543 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.98 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  53.54 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.52 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  40.15 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
130 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.06 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.68 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.31 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.91 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.8 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.45 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.85 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.23 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.85 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  41.09 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.98 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.38 
 
 
125 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.33 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>