285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2872 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.76 
 
 
139 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  71.54 
 
 
133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.47 
 
 
134 aa  194  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.47 
 
 
134 aa  194  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.18 
 
 
158 aa  192  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  68.46 
 
 
140 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.12 
 
 
139 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.42 
 
 
134 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.42 
 
 
134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.4 
 
 
139 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.46 
 
 
133 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.89 
 
 
142 aa  184  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  65.41 
 
 
145 aa  183  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.15 
 
 
139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.36 
 
 
136 aa  178  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.36 
 
 
136 aa  177  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.71 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.71 
 
 
139 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.18 
 
 
146 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.12 
 
 
137 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.12 
 
 
142 aa  175  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.6 
 
 
137 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.12 
 
 
137 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.61 
 
 
135 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.31 
 
 
136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.67 
 
 
139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.64 
 
 
133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.43 
 
 
139 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.12 
 
 
133 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.83 
 
 
139 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.54 
 
 
150 aa  168  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.54 
 
 
135 aa  167  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.12 
 
 
132 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  63.28 
 
 
134 aa  163  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.82 
 
 
133 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.54 
 
 
136 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.46 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.73 
 
 
136 aa  135  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.65 
 
 
126 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.79 
 
 
138 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.73 
 
 
126 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.31 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.18 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  44 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.91 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.06 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
126 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.96 
 
 
129 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.48 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.15 
 
 
543 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.48 
 
 
131 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
132 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
132 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  43 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.28 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.02 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.3 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.32 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.88 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.48 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  43.01 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.51 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.68 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.28 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.92 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>