276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0654 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  76.92 
 
 
132 aa  210  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  70.31 
 
 
130 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.15 
 
 
130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  67.19 
 
 
543 aa  178  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.62 
 
 
130 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.62 
 
 
130 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.57 
 
 
130 aa  175  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.6 
 
 
132 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.5 
 
 
131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 
146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 
146 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.54 
 
 
158 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.24 
 
 
146 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.24 
 
 
142 aa  158  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.24 
 
 
148 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.24 
 
 
148 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
143 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
143 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
143 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
143 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
143 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
143 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
143 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.94 
 
 
146 aa  156  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.46 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.69 
 
 
140 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.14 
 
 
138 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.49 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.36 
 
 
147 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.59 
 
 
138 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.12 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.12 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.34 
 
 
143 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.91 
 
 
140 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  44.53 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.64 
 
 
125 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.61 
 
 
136 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.91 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.91 
 
 
136 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.61 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
126 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
126 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 
126 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.34 
 
 
137 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.18 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.21 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  37.21 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.61 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 
124 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
125 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  37.98 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.85 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.85 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0728  Holo-acyl carrier protein synthase  43.61 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.36 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.46 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
126 aa  84  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.04 
 
 
142 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.85 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.85 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.74 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.16 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.1 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0868  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.19 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0432796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1012  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.19 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.38 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.81 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.31 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>