263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1014 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
146 aa  293  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  98.62 
 
 
146 aa  287  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  92.47 
 
 
142 aa  266  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  90.54 
 
 
148 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  90.54 
 
 
148 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  90.34 
 
 
146 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.15 
 
 
146 aa  259  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.02 
 
 
143 aa  243  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.02 
 
 
143 aa  243  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.02 
 
 
143 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.02 
 
 
143 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.02 
 
 
143 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.02 
 
 
143 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  92.25 
 
 
143 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  92.25 
 
 
143 aa  241  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  86.15 
 
 
140 aa  234  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  82.48 
 
 
158 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  83.08 
 
 
135 aa  227  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  70.23 
 
 
138 aa  200  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.88 
 
 
138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.09 
 
 
147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.91 
 
 
140 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.14 
 
 
143 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 
132 aa  169  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.4 
 
 
130 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 
130 aa  154  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
136 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.91 
 
 
130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.91 
 
 
130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 
130 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.92 
 
 
131 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.25 
 
 
130 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  50 
 
 
543 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.16 
 
 
132 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  41.73 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.61 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.12 
 
 
146 aa  89  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.29 
 
 
141 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.09 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.88 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  35.88 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.55 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.09 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  35.34 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.77 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.66 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0728  Holo-acyl carrier protein synthase  40.46 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.42 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.41 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.03 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  36 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.48 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.85 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.85 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.92 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.8 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.87 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.21 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>