295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2167 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  48 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 
126 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
125 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
125 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.65 
 
 
129 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  41.46 
 
 
125 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.27 
 
 
126 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.03 
 
 
137 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.03 
 
 
137 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  44.35 
 
 
128 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.65 
 
 
131 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 
125 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.2 
 
 
126 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.09 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.54 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.65 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.28 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  43.09 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.89 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.09 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.31 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.27 
 
 
139 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.86 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.31 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.31 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.09 
 
 
123 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.31 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.52 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.75 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.22 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.62 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.44 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.45 
 
 
543 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.52 
 
 
139 aa  90.5  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  37.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.41 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.11 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.27 
 
 
127 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
123 aa  89  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.3 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.65 
 
 
125 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0728  Holo-acyl carrier protein synthase  47.15 
 
 
131 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
130 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.1 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.02 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  36 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.24 
 
 
136 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.56 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
121 aa  84  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
125 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.73 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.34 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.71 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.09 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>