268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0728 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0728  Holo-acyl carrier protein synthase  100 
 
 		 131 aa  266  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.4 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  52.8 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  45.24 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0868  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0432796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1012  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.15 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.38 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.61 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.92 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.22 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.48 
 
 		 543 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 158 aa  95.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  38.71 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.06 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.02 
 
 		 126 aa  84.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.9 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.06 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.52 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.37 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.68 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.2 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.35 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.24 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.84 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.43 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.09 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.3 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.92 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>