257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0417 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  91.54 
 
 
130 aa  253  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.8 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.8 
 
 
158 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.21 
 
 
146 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.64 
 
 
138 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.8 
 
 
142 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.8 
 
 
148 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.8 
 
 
148 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.8 
 
 
146 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.02 
 
 
138 aa  156  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.2 
 
 
140 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.89 
 
 
147 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
146 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.69 
 
 
146 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
143 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 
143 aa  153  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 
140 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.12 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.39 
 
 
132 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.15 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.46 
 
 
130 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.06 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.82 
 
 
130 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.74 
 
 
543 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.96 
 
 
130 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.96 
 
 
130 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.19 
 
 
132 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  41.73 
 
 
125 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
126 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
126 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.22 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.86 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  36.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.34 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.72 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  36.51 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.83 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  33.33 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.5 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.61 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1684  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.31 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1327  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.71 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122179  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.5 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.34 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.59 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.07 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.82 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.11 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.69 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>