276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1684 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1684  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
117 aa  243  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  70.94 
 
 
119 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  70.94 
 
 
119 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.54 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.15 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.86 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.85 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.85 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.85 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.85 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.85 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.85 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.54 
 
 
119 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0254  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.03 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0462936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0266  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.76 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5060  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.15 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0265  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.15 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.771008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.61 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1702  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  42.06 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  87  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
127 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
126 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.26 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.58 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.76 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.41 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0238  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.98 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
126 aa  77  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  34.13 
 
 
125 aa  76.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.09 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.07 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.28 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1813  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.28 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.31 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.06 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.22 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1863  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.52 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0348808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.06 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.08 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.22 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1754  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.68 
 
 
258 aa  70.5  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.61 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.88 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.83 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.78 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.43 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.78 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.08 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.5 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>