270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0909 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
119 aa  246  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0254  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.15 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0462936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1702  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.26 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.83 
 
 
119 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.83 
 
 
119 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.9 
 
 
119 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
129 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.31 
 
 
119 aa  110  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1684  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.54 
 
 
117 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.74 
 
 
119 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.74 
 
 
119 aa  103  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.74 
 
 
119 aa  103  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.74 
 
 
119 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.74 
 
 
119 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.74 
 
 
119 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.9 
 
 
119 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.9 
 
 
119 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.57 
 
 
119 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0266  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.17 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0265  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.34 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.771008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5060  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.34 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.91 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  43.31 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  40.48 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.98 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.6 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  36.15 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.82 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  37.3 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.1 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.52 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.01 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1813  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.05 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.1 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.08 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.82 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  31.75 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.43 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.86 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.18 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.18 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.83 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.38 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.92 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.05 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0868  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0432796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1012  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.05 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.05 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.11 
 
 
543 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.15 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.91 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  40.91 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.9 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>