257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2126 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  100 
 
 
127 aa  260  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.18 
 
 
113 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.51 
 
 
125 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.32 
 
 
125 aa  90.5  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.15 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.6 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
125 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
125 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.46 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.43 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.8 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.5 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  36.89 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  40 
 
 
179 aa  77  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0138  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.6 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000309691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.92 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  40.16 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.97 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  34.65 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.38 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.52 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.3 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.22 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.22 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.92 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
148 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
148 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.83 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.11 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.47 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.86 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  34.92 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1283  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  33.33 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.86 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.8 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.25 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  36.72 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.82 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.82 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1073  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.97 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>