279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2565 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
120 aa  246  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.41 
 
 
118 aa  174  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.26 
 
 
119 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.26 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.55 
 
 
122 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.86 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.3 
 
 
123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  43.09 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.17 
 
 
126 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.66 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.09 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.83 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.66 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.02 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.39 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.98 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.22 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.2 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.84 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.53 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.53 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.35 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.35 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.35 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.02 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.59 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.32 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.82 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.23 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.9 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.52 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.29 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.45 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.17 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  35.25 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  34.17 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.98 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  34.17 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.65 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.02 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.02 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.71 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.3 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.65 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.65 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.83 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.21 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.67 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.02 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>