227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1668 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.13 
 
 
123 aa  87.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.65 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.03 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.52 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.83 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1327  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122179  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.17 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0521  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.97 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000822969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.78 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.15 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.52 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.21 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.04 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.34 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3109  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  38.79 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.016377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.96 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.83 
 
 
119 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.07 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  34.17 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1073  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.43 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.82 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  35.83 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.65 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.6 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
118 aa  66.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.79 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0138  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.9 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000309691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.93 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.36 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1740  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.61 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.84 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.45 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.38 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.2 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.69 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.4 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.01 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.83 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  27.73 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  29.75 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3160  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  31.36 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.13 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.92 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.92 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.64 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0010  holo-[acyl-carrier-protein] synthase (Holo-ACP synthase)  37.19 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.51 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.41 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.56 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.87 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.47 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  26.98 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.56 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.78 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.54 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.75 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.71 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.67 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.77 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  31.93 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.4 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.51 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0962  holo-(acyl-carrier protein) synthase  37.1 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.539691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  28 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.27 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.61 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.8 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.1 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>