282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0376 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
125 aa  258  1e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.83 
 
 
143 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.57 
 
 
122 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.96 
 
 
126 aa  100  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.03 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  44.96 
 
 
128 aa  95.9  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.72 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.34 
 
 
119 aa  90.1  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.17 
 
 
127 aa  90.1  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.32 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  43.8 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.14 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.72 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.02 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  37.19 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  44.72 
 
 
119 aa  84.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.28 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.19 
 
 
121 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.66 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.97 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  40.83 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  41.41 
 
 
196 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1327  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.36 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122179  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.7 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.68 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.03 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.34 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.21 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.32 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.94 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.75 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.46 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.15 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.75 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.52 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.45 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.53 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.45 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.88 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.75 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.86 
 
 
543 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.05 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  36.22 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.38 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.36 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.54 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.68 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.97 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.58 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.98 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.56 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.56 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.61 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.92 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.44 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  39.34 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.75 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  50.68 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.09 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.71 
 
 
131 aa  67  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.92 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>