291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6616 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
135 aa  270  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  81.54 
 
 
136 aa  221  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.77 
 
 
136 aa  219  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  80 
 
 
136 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  88.46 
 
 
132 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  73.68 
 
 
133 aa  202  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  85.38 
 
 
136 aa  201  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  72.31 
 
 
134 aa  200  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  70 
 
 
134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.54 
 
 
139 aa  194  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  70.77 
 
 
135 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  70.9 
 
 
140 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  70 
 
 
158 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.69 
 
 
134 aa  183  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.69 
 
 
134 aa  183  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.17 
 
 
133 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.46 
 
 
133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  68.94 
 
 
145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.12 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.12 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.44 
 
 
146 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.12 
 
 
137 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.69 
 
 
139 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.62 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.16 
 
 
139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.34 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.54 
 
 
139 aa  170  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.43 
 
 
139 aa  170  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.43 
 
 
139 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  70 
 
 
134 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.69 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 
141 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.87 
 
 
135 aa  161  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.92 
 
 
133 aa  160  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.18 
 
 
139 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.04 
 
 
150 aa  153  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.72 
 
 
139 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.63 
 
 
133 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.47 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.37 
 
 
132 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.45 
 
 
127 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.37 
 
 
130 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.37 
 
 
130 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.44 
 
 
130 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.61 
 
 
543 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
131 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.62 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.19 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.94 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.53 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.46 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.06 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.09 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.82 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
126 aa  92  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.09 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  53 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
125 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.37 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.81 
 
 
138 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.94 
 
 
124 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.06 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
123 aa  85.5  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.64 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.5 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
122 aa  84.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.06 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.76 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
125 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  52.27 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.45 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  45.31 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.43 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.91 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.91 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.29 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.51 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>