More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2322 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
129 aa  265  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  73.6 
 
 
125 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  72 
 
 
125 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.6 
 
 
126 aa  186  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  64 
 
 
126 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.45 
 
 
126 aa  150  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.6 
 
 
127 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  53.72 
 
 
128 aa  130  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  44 
 
 
125 aa  110  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.26 
 
 
131 aa  104  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.65 
 
 
141 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40 
 
 
125 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.7 
 
 
123 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.7 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  42.5 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
137 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
125 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.94 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.67 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
134 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
134 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.1 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.13 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.37 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
139 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
133 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  43.09 
 
 
196 aa  87.8  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.37 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
136 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.74 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.22 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.03 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
133 aa  84.7  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.19 
 
 
145 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.14 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
139 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  40.32 
 
 
179 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.96 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  34.96 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.5 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.53 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.62 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.1 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>