290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2138 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
126 aa  255  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.26 
 
 
120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.7 
 
 
119 aa  130  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.14 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.28 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.01 
 
 
122 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.14 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.96 
 
 
125 aa  100  7e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.62 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.8 
 
 
123 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.02 
 
 
125 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.76 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.68 
 
 
125 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
126 aa  87  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.76 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.55 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.14 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.94 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.45 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  42.02 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.67 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  38.02 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.53 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.32 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  36.67 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.84 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.06 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.66 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.83 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.67 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1740  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.26 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.44 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.27 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.75 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.09 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.52 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.59 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3109  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  34.75 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.016377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.82 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.61 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.05 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  35.83 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.61 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.8 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.88 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  43.82 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  37.61 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.13 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.71 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  36.89 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.7 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.05 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.62 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.68 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  35 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.61 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.19 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1391  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.03 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.21 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>