297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0287 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
133 aa  262  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  96.99 
 
 
133 aa  254  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.88 
 
 
138 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.46 
 
 
131 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.64 
 
 
119 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  38.71 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.74 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.83 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.06 
 
 
121 aa  94  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.94 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 
126 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.65 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.27 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.74 
 
 
134 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
126 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
123 aa  87  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  38.1 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.37 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0903  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.06 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.98 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.17 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.98 
 
 
119 aa  84.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.64 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.31 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  39.68 
 
 
196 aa  84.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  37.7 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.93 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  38.58 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.51 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.66 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0238  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  41.41 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.06 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.72 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.1 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  37.6 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.52 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.82 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.53 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  35.16 
 
 
117 aa  77  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.54 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.54 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.19 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1702  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1684  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  31.58 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.59 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.66 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.22 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>