287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1701 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
127 aa  259  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.1 
 
 
123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.92 
 
 
124 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.4 
 
 
124 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.24 
 
 
130 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0280  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.92 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.346629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.73 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.96 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  42.74 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.27 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  40.32 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.02 
 
 
125 aa  88.6  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  42.74 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.65 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.03 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2044  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.54 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.9 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.98 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.9 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.67 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.13 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  44 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.6 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.1 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.27 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.15 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.02 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.23 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.21 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.11 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.27 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0903  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.52 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.11 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1351  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.86 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0301322  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.67 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.09 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.82 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.61 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1684  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.22 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.31 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.34 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.64 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.17 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  40.31 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.13 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  37.39 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.35 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.52 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>