278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0422 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
119 aa  248  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  88.24 
 
 
119 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  87.39 
 
 
119 aa  216  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.8 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  50 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.26 
 
 
126 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.35 
 
 
136 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.76 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.76 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.5 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.04 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1313  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.4 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  43.09 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.74 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.67 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  41.32 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.82 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.21 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.13 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.55 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.98 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.98 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.02 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.18 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1073  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.32 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.61 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.32 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.94 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.11 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0138  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.32 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000309691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.34 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.8 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.89 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.9 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.96 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  34.96 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.89 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  41.18 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.02 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0521  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.84 
 
 
124 aa  67  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000822969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.84 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.29 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.79 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.3 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  35 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.58 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.75 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.04 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.9 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.71 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.45 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.35 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09407  Fatty acid synthase, alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78615]  35 
 
 
1860 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00116938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.57 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.02 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>