251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0254 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0254  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
120 aa  248  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0462936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1702  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.67 
 
 
119 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0266  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.74 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.15 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.83 
 
 
119 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.38 
 
 
119 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.52 
 
 
129 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.22 
 
 
119 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1684  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.03 
 
 
117 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 
119 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.32 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1642  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  44.26 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00164827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5060  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.82 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0265  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.23 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.771008  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.82 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1813  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.21 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.02 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  41.57 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.45 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.75 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.3 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.78 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.78 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.04 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.78 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.78 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.23 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.13 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.38 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.61 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.23 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  33.62 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.06 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.92 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.08 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0238  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.08 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.08 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.48 
 
 
543 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.26 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.5 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.72 
 
 
176 aa  60.5  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.39 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.63 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.78 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.68 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.92 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1863  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  43.82 
 
 
270 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0348808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.78 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  32.54 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.63 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.41 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.63 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.41 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.82 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.88 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1391  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.63 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.56 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.95 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.69 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.78 
 
 
126 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.74 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.84 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1319  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.2 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.48 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.48 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.48 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.48 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.07 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.48 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.11 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.95 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  27.5 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.37 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>