270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4464 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
130 aa  253  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.75 
 
 
122 aa  153  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.94 
 
 
122 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.46 
 
 
122 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.04 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  61.16 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.02 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.06 
 
 
119 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.64 
 
 
115 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.1 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.64 
 
 
115 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4269  holo-acyl-carrier-protein synthase  62.6 
 
 
126 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.5 
 
 
114 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.81 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.11 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  55.37 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  57.38 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.14 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  52.78 
 
 
117 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0897  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.89 
 
 
116 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.65 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29290  phosphopantethiene--protein transferase  58.72 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.4 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.25 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  43.22 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.77 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.86 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.19 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23180  phosphopantethiene--protein transferase  51.85 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.496529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.75 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.62 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.4 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  40.5 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  38.21 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.33 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.41 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.84 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.13 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  35 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.68 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1995  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.64 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  66.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.51 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  38.52 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.39 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.3 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.22 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.45 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.97 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.5 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.21 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.04 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2332  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.24 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.909639  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.9 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  34.15 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.64 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.5 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.75 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1316  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.54 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.436296  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.75 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.33 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.51 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4124  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.898088  normal  0.404678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12544  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000254909  hitchhiker  0.00872377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.3 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  34.38 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.94 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0435  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.64 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.46 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.08 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3647  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>