264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3084 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
116 aa  221  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.48 
 
 
116 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.84 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.61 
 
 
116 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  69.23 
 
 
117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  62.81 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.13 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  60 
 
 
115 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.26 
 
 
117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.66 
 
 
122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.84 
 
 
122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  56.56 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4269  holo-acyl-carrier-protein synthase  63.48 
 
 
126 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29290  phosphopantethiene--protein transferase  67.96 
 
 
116 aa  121  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.25 
 
 
126 aa  120  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  56.64 
 
 
114 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  55.65 
 
 
119 aa  116  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  52.94 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  56.73 
 
 
117 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.28 
 
 
118 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0897  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.17 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.54 
 
 
131 aa  89.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.2 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.9 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23180  phosphopantethiene--protein transferase  53.85 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.496529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  42.74 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  40.68 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.68 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.02 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.54 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.71 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.8 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  37.82 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.34 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.25 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.29 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  39.02 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.29 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.38 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.48 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.97 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.92 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  35.77 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.87 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.13 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.52 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0435  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.44 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.16 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.86 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.79 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.6 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  37.9 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0801  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.74 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.75 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.88 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.15 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.55 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.61 
 
 
543 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2366  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.6 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  35.77 
 
 
179 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.6 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.54 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.15 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>