254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_29290  phosphopantethiene--protein transferase  100 
 
 
116 aa  229  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.35 
 
 
116 aa  147  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.31 
 
 
119 aa  140  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  70.87 
 
 
117 aa  140  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.96 
 
 
116 aa  138  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  61.21 
 
 
117 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.87 
 
 
115 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.87 
 
 
116 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.74 
 
 
115 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.02 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.5 
 
 
122 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.68 
 
 
122 aa  123  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.1 
 
 
126 aa  120  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4269  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.66 
 
 
126 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  55.74 
 
 
122 aa  119  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  56.9 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.52 
 
 
114 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.58 
 
 
118 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.74 
 
 
135 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  53.85 
 
 
117 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0897  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.65 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23180  phosphopantethiene--protein transferase  55.34 
 
 
147 aa  87  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.496529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.9 
 
 
131 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.6 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  42.37 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.48 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.76 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.98 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  38.98 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.52 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.79 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.06 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.23 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.59 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  38.21 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  32.26 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.48 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.07 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.89 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.2 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.21 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.44 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.18 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.88 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2366  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.8 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  39.84 
 
 
196 aa  62  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.54 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1927  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.29 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.125964  normal  0.348533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.36 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  35.48 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2332  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.909639  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.16 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.26 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  37.1 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.11 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.21 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.64 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>