274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0897 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0897  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
116 aa  226  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  65.29 
 
 
130 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.48 
 
 
116 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.39 
 
 
115 aa  130  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.39 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.38 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.04 
 
 
116 aa  124  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.76 
 
 
117 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  56.9 
 
 
119 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  61.17 
 
 
117 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4269  holo-acyl-carrier-protein synthase  66.95 
 
 
126 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.85 
 
 
122 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.02 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.65 
 
 
119 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.17 
 
 
116 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.24 
 
 
135 aa  115  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  57.69 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  56.52 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.41 
 
 
126 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.77 
 
 
118 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.97 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29290  phosphopantethiene--protein transferase  58.65 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  46.61 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.53 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.4 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
125 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.65 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.29 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.29 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23180  phosphopantethiene--protein transferase  49.51 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.496529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  41.18 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.61 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.77 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.38 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.72 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.74 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  36.21 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.4 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.13 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.59 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.39 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.88 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.88 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.68 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.24 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  34.68 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.52 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  34.68 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.43 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  33.87 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.25 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.46 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.62 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.6 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.31 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.73 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>