251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1188 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
135 aa  263  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  61.34 
 
 
122 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.03 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.34 
 
 
122 aa  143  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.02 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.85 
 
 
116 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.24 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.41 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  50.83 
 
 
114 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.11 
 
 
116 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.21 
 
 
118 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.18 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.4 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.38 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4269  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.26 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.66 
 
 
117 aa  90.1  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  49.54 
 
 
117 aa  90.1  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.71 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.67 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0897  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.83 
 
 
116 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  37.21 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29290  phosphopantethiene--protein transferase  48.6 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  37.82 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  36.75 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.13 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0435  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.87 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.83 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  30 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.75 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.33 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.2 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  31.97 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.94 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.83 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.23 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.23 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  32.79 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  28 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  31.58 
 
 
179 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.71 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.09 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.26 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.4 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.71 
 
 
120 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23180  phosphopantethiene--protein transferase  41.12 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.496529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.05 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.8 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.93 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.59 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.71 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.8 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  27.27 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.18 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.87 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.17 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.89 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.96 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  33.33 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.51 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.51 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.51 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>