259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0620 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
118 aa  225  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  65 
 
 
130 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  65 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.17 
 
 
122 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.04 
 
 
114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.34 
 
 
116 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.48 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.68 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.65 
 
 
115 aa  123  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.91 
 
 
116 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.65 
 
 
115 aa  120  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  55.83 
 
 
135 aa  120  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4269  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.13 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  58.65 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.69 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.31 
 
 
117 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.55 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.81 
 
 
117 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.28 
 
 
116 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29290  phosphopantethiene--protein transferase  60.58 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 
126 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.28 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0897  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.77 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.09 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  36.97 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.83 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  42.28 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  49.19 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.58 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  50 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  38.14 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.14 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.26 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.88 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.9 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.68 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.29 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.21 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.34 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23180  phosphopantethiene--protein transferase  48.54 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.496529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.52 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.68 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  39.84 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0435  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.04 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  36.44 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.71 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  35.71 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  33.61 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.5 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  32.81 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3647  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3720  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155261  normal  0.66962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3660  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0758306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.43 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2332  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.39 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.909639  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2366  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.39 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  38.84 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1316  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.436296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.04 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.1 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>