275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0839 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
121 aa  243  8e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1319  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.78 
 
 
115 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103169  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.51 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0878  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.75 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0696811  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1391  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.87 
 
 
114 aa  124  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.79 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1408  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.79 
 
 
115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1596  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.89 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  44.26 
 
 
124 aa  102  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
141 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.34 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.36 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.67 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0521  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.98 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000822969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.75 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.59 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.12 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.93 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.4 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.91 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.09 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  33.88 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.89 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.4 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.23 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  32.23 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.25 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.23 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.07 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.09 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  31.4 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.33 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.4 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.71 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.79 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  35.54 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.65 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  35 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.79 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.4 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.77 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.75 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  35 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.61 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.2 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.2 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.39 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.2 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.52 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.8 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1316  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.69 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.436296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.8 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.7 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0962  holo-(acyl-carrier protein) synthase  32.2 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.539691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.09 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  29.17 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5060  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.22 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.77 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.6 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>