194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1316 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1316  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
127 aa  252  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.436296  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3647  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.85 
 
 
130 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3720  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.85 
 
 
130 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155261  normal  0.66962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3660  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.85 
 
 
130 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0758306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12544  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.47 
 
 
130 aa  146  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000254909  hitchhiker  0.00872377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4124  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.15 
 
 
133 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.898088  normal  0.404678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2533  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.38 
 
 
133 aa  139  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58472  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1995  holo-acyl-carrier-protein synthase  53.49 
 
 
130 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.19 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.27 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.54 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.69 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0903  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.23 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.69 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.43 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.85 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.94 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  30.53 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.15 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.01 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  34.65 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.01 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.97 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.58 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  32.58 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.68 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.82 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.25 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.6 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  40 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  36.22 
 
 
196 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.06 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.56 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.24 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.5 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.34 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.36 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.95 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
123 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.06 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.16 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.08 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.85 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1635  phosphopantetheinyl transferase  30.68 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.25448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.06 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.33 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.06 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.06 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.06 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.06 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.75 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.06 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1194  phosphopantethiene--protein transferase domain protein  30.97 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0435  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.29 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  30.3 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.55 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.03 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.58 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.79 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0521  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.23 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000822969  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.13 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.13 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.93 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.82 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1319  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.25 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>