183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1995 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1995  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
130 aa  258  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3647  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.84 
 
 
130 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3720  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.84 
 
 
130 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155261  normal  0.66962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3660  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.84 
 
 
130 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0758306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12544  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.34 
 
 
130 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000254909  hitchhiker  0.00872377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4124  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.06 
 
 
133 aa  173  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.898088  normal  0.404678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2533  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.06 
 
 
133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58472  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1316  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.49 
 
 
127 aa  135  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.436296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.64 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.78 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.01 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.59 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.01 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1194  phosphopantethiene--protein transferase domain protein  32.91 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.11 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.96 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1740  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.07 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.43 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.85 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  31.78 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.59 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  32.28 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.01 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.16 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.61 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.01 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.3 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.8 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.09 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.32 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.66 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.82 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.08 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  33.33 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4137  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.83 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0623  holo-(acyl-carrier protein) synthase, truncation  43.9 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.37 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.13 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.94 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.01 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  27.91 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.61 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.88 
 
 
134 aa  52  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.66 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.32 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.01 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.47 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  34.62 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1635  phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.25448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 
122 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.3 
 
 
126 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
136 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.03 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.3 
 
 
126 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.6 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  27.34 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.92 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.77 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3109  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  29.37 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.016377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.72 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.06 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09407  Fatty acid synthase, alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78615]  32.8 
 
 
1860 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00116938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.3 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.3 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  31.3 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.01 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  29.46 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  28.79 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.58 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.07 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.82 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.81 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  25.95 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1073  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.9 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>