191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1927 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1927  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
134 aa  266  8e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.125964  normal  0.348533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1327  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.4 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122179  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.6 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.37 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.58 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.92 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.97 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.86 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.85 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.14 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  33.85 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.85 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.36 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.26 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.07 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  36.43 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  44.27 
 
 
196 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.04 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.17 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  37.12 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.59 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.06 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.81 
 
 
543 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.59 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.43 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.19 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.07 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  32.03 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  37.5 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  35.71 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.59 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.03 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.58 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  31.25 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.56 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.96 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.81 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0658  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.81 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1138  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.81 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0010  holo-[acyl-carrier-protein] synthase (Holo-ACP synthase)  27.91 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.35 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.6 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.78 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.23 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.85 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.23 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.61 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.08 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
122 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.31 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0138  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.98 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000309691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.35 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.23 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  38.79 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.23 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.69 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
176 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.07 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  41.91 
 
 
128 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
135 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.65 
 
 
128 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.82 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.11 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.47 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.47 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>