More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2549 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 
407 aa  811    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  65.92 
 
 
407 aa  528  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  63.03 
 
 
405 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  58.46 
 
 
402 aa  461  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  40.29 
 
 
409 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 
412 aa  259  7e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  41.23 
 
 
408 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  37.77 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  40.1 
 
 
404 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  36.27 
 
 
415 aa  242  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  34.78 
 
 
414 aa  242  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  38.14 
 
 
396 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  35.97 
 
 
414 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  35.06 
 
 
413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  34.41 
 
 
419 aa  236  8e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  35.73 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  36.36 
 
 
414 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  35.12 
 
 
412 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  37.99 
 
 
404 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 
407 aa  230  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  36.45 
 
 
409 aa  231  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 
398 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  39.59 
 
 
388 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  38.93 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 
411 aa  226  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  34.9 
 
 
408 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 
396 aa  224  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  36.48 
 
 
408 aa  222  7e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  39.23 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  34.65 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  38.14 
 
 
398 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 
398 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  39.95 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 
394 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  38.7 
 
 
400 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  38.46 
 
 
400 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  34.41 
 
 
408 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  38.13 
 
 
400 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 
413 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
399 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  37.32 
 
 
402 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  36.04 
 
 
408 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  35.38 
 
 
405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  36.19 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.29 
 
 
646 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  37.35 
 
 
397 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  37.07 
 
 
398 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  35.9 
 
 
402 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  35.75 
 
 
409 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  36.25 
 
 
396 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  37.56 
 
 
398 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  37.77 
 
 
398 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  38.73 
 
 
398 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  35.96 
 
 
407 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  36.93 
 
 
400 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  38.93 
 
 
399 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  37.65 
 
 
398 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  36.25 
 
 
407 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  38.68 
 
 
399 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 
394 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  37.75 
 
 
392 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  37.34 
 
 
399 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  35.99 
 
 
394 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  36.78 
 
 
393 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.25 
 
 
650 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  37.14 
 
 
398 aa  202  9e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  36.5 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  36.54 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  34.6 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  33.82 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  35.14 
 
 
389 aa  199  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  35.61 
 
 
395 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  35.57 
 
 
395 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  35.75 
 
 
396 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  36.13 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  35.37 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  33.65 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  35.8 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  34.77 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  34.14 
 
 
443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  35.12 
 
 
395 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  36.39 
 
 
388 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  33.84 
 
 
396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  35.15 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  35.73 
 
 
401 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  33.42 
 
 
394 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  33.16 
 
 
394 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  33.16 
 
 
394 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  34.9 
 
 
397 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  33.16 
 
 
394 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  34.95 
 
 
401 aa  195  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  33.16 
 
 
394 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  32.91 
 
 
394 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  32.91 
 
 
394 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>