More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0780 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  94.69 
 
 
414 aa  802    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
414 aa  841    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  96.86 
 
 
414 aa  816    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  82.81 
 
 
414 aa  724    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  66.59 
 
 
419 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  49.28 
 
 
412 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 
404 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  48.9 
 
 
408 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  48.05 
 
 
404 aa  365  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  48.42 
 
 
405 aa  362  8e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 
413 aa  358  9e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  46 
 
 
413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 
407 aa  350  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  45.99 
 
 
409 aa  346  4e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  47.69 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  44.96 
 
 
404 aa  342  5e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  43.57 
 
 
408 aa  335  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  45.26 
 
 
409 aa  333  3e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  42.08 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  41.58 
 
 
412 aa  323  3e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  39.31 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  38.85 
 
 
408 aa  298  2e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  40.8 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  40.49 
 
 
411 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  40.45 
 
 
408 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  38.83 
 
 
408 aa  267  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  39.95 
 
 
397 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  40.38 
 
 
393 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  39.38 
 
 
394 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.66 
 
 
646 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.3 
 
 
650 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  38.5 
 
 
397 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  38.26 
 
 
397 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  39.13 
 
 
396 aa  250  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  39.27 
 
 
393 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.01 
 
 
655 aa  248  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  39.17 
 
 
394 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 
393 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  40.29 
 
 
399 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  38.42 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  38.42 
 
 
394 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  39.81 
 
 
399 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  38.42 
 
 
394 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  38.2 
 
 
394 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  38.18 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  38.08 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  37.84 
 
 
394 aa  242  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  37.93 
 
 
394 aa  242  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  38.18 
 
 
394 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  38.18 
 
 
394 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  39.56 
 
 
393 aa  241  1e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  38.83 
 
 
396 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  38.18 
 
 
394 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  38.85 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  38.18 
 
 
394 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  36.67 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  36.56 
 
 
394 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  37.38 
 
 
395 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  35.97 
 
 
407 aa  237  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  35.95 
 
 
397 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  36.43 
 
 
393 aa  236  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  35.32 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  39.14 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  36.6 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  37.56 
 
 
394 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  37.32 
 
 
389 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  35.99 
 
 
395 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  38.33 
 
 
403 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  38.11 
 
 
400 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  35.45 
 
 
407 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  35.45 
 
 
403 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  37.11 
 
 
402 aa  229  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  35.89 
 
 
392 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  39.56 
 
 
402 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  35.73 
 
 
397 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  38.28 
 
 
400 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  35.75 
 
 
395 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  38.28 
 
 
400 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  36.87 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  35.32 
 
 
443 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  35.32 
 
 
395 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  37.38 
 
 
399 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  37.2 
 
 
401 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  37.35 
 
 
399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  35.85 
 
 
392 aa  223  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  36.02 
 
 
403 aa  222  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  37.38 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  36.78 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  36.45 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  36.45 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  34.77 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  37.35 
 
 
401 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  34.67 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  34.3 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  37.5 
 
 
395 aa  219  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  37.05 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  34.22 
 
 
396 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  34.53 
 
 
397 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  37.32 
 
 
394 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>