More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1345 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
413 aa  833    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  70.1 
 
 
412 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  58.37 
 
 
404 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  51.72 
 
 
413 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
408 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 
407 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  47.23 
 
 
419 aa  376  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  46.95 
 
 
404 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  47.39 
 
 
405 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 
414 aa  364  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  48.45 
 
 
388 aa  359  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  46.49 
 
 
414 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  46 
 
 
414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  45.76 
 
 
414 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  43.89 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  43.42 
 
 
408 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  44.64 
 
 
404 aa  326  5e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  42.11 
 
 
412 aa  319  7e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  41.19 
 
 
409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  42.61 
 
 
415 aa  312  7.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  38.81 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  38.21 
 
 
408 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  37.76 
 
 
408 aa  270  4e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 
408 aa  265  8e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  35.62 
 
 
411 aa  256  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  35.46 
 
 
408 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  39.56 
 
 
389 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  38.12 
 
 
393 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.99 
 
 
650 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  36.79 
 
 
394 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 
393 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  35.77 
 
 
403 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 
407 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  36.43 
 
 
396 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  35.8 
 
 
389 aa  226  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  35.85 
 
 
396 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  36.3 
 
 
393 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  34.88 
 
 
396 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  35.8 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.64 
 
 
646 aa  222  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  35.31 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  36.7 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  36.3 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  34.57 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
395 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  36.08 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  35.15 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 
399 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  35.28 
 
 
400 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  36.43 
 
 
394 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 
407 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  36.21 
 
 
402 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  35.78 
 
 
399 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  34.39 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.52 
 
 
655 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  36.7 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  34.74 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  35.8 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  35.37 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  36.52 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 
398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  34.24 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  35.31 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  35.31 
 
 
394 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  35.31 
 
 
394 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  36.67 
 
 
401 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  34.15 
 
 
398 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  35.89 
 
 
394 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
401 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  35.44 
 
 
401 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  36.88 
 
 
394 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  33.74 
 
 
399 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  34.84 
 
 
409 aa  210  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  33.41 
 
 
402 aa  210  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  34.64 
 
 
397 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  36.67 
 
 
399 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 
397 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  32.84 
 
 
392 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  34.32 
 
 
402 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  33.41 
 
 
398 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  34.4 
 
 
397 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  33.99 
 
 
396 aa  207  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  37.07 
 
 
399 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 
393 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  37.19 
 
 
399 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  34.58 
 
 
401 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  36.86 
 
 
399 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  33.9 
 
 
398 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  35.61 
 
 
404 aa  207  4e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  34.88 
 
 
398 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  34.49 
 
 
401 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  34.56 
 
 
396 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>