More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2372 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 407 aa  804    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  75.12 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  65.92 
 
 		 407 aa  528  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  63.43 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  44.04 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  42.16 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  43.81 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  40.63 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  39.02 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  38.7 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  37.01 
 
 		 413 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  38.48 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  42.03 
 
 		 388 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  35 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  37.34 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  39.56 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  37.47 
 
 		 412 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  36.87 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  34.23 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  35.45 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  40.1 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  38.52 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  41.18 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  34.96 
 
 		 414 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  36.12 
 
 		 408 aa  229  8e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  35.21 
 
 		 414 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  38.6 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  37.24 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  35.42 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  40.15 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  39.9 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  39.8 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  36.9 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  40.82 
 
 		 400 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  40.1 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  40.68 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  37.4 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  40.44 
 
 		 400 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  35.9 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  38.13 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  40.05 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  39.76 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  38.39 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  39.13 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  38.41 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  37.82 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  38.32 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  36.92 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  38.07 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  35.84 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  38.88 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  36.09 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  35.87 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  39.02 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  39.27 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  38.98 
 
 		 400 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  36.78 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  36.78 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  36.78 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  35.46 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  35.87 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  38.69 
 
 		 415 aa  206  9e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  38.92 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  38.83 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  38.44 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  37.35 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  37.9 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.9 
 
 		 655 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  37.24 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  36.16 
 
 		 395 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  39.56 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  38.39 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  36.83 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  35.12 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  32.08 
 
 		 398 aa  202  9e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  35.31 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  37.92 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  35.88 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.26 
 
 		 687 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  35.95 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  35.84 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  37.56 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  37.92 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  37.09 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  36.86 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  35.7 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  34.23 
 
 		 397 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  34.18 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  35 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  34.84 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  35 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  36.36 
 
 		 388 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  37.2 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  33.66 
 
 		 646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.4 
 
 		 650 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>