More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1600 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  87.28 
 
 
404 aa  699    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 
408 aa  808    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 
404 aa  346  5e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  43.57 
 
 
414 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  44.03 
 
 
405 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  44.8 
 
 
408 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  44.91 
 
 
407 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  42.86 
 
 
414 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  43.1 
 
 
414 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 
404 aa  333  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  48.71 
 
 
388 aa  329  6e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  43.42 
 
 
413 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  41.2 
 
 
419 aa  326  6e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  41.69 
 
 
414 aa  323  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 
409 aa  324  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  40.9 
 
 
413 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  43 
 
 
409 aa  306  3e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  41.69 
 
 
415 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  41.44 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  40.74 
 
 
408 aa  293  5e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  40.69 
 
 
407 aa  286  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  42.26 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  42.78 
 
 
411 aa  279  5e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  43.32 
 
 
408 aa  279  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  41.4 
 
 
408 aa  277  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  44.04 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  42 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  41.23 
 
 
407 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  38.44 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  42.86 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  38.28 
 
 
399 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  36.97 
 
 
396 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  38.28 
 
 
399 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  37.35 
 
 
392 aa  232  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
389 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  37.5 
 
 
393 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.69 
 
 
650 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  37.75 
 
 
394 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  38.35 
 
 
394 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 
396 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 
393 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  36.27 
 
 
394 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  39.01 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  37.41 
 
 
403 aa  226  7e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  35.85 
 
 
393 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  38.42 
 
 
398 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  38.37 
 
 
395 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  35.47 
 
 
395 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  39.47 
 
 
392 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  34.47 
 
 
443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  38.29 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.44 
 
 
655 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  38.63 
 
 
400 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  38.78 
 
 
395 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  36.3 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  36.3 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  39.13 
 
 
400 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  35.87 
 
 
397 aa  219  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 
394 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  38.22 
 
 
407 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.59 
 
 
646 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  37.25 
 
 
393 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 
394 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  36.83 
 
 
401 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.57 
 
 
687 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 
407 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 
407 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 
394 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 
407 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  35.87 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  37.41 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  35.78 
 
 
394 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  37.65 
 
 
399 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  35.78 
 
 
394 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 
394 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  37.19 
 
 
398 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  36.45 
 
 
398 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  38.33 
 
 
393 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  35.82 
 
 
400 aa  216  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  39.95 
 
 
415 aa  216  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  39.16 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  36.95 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  35.38 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  40 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  35.78 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  36.52 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  35.29 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  38.05 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  38.5 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  38.39 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  39.51 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  34.78 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  36.76 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  35.12 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>