More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1808 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 412 aa  828    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  70.1 
 
 		 413 aa  580  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  58.27 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  51.38 
 
 		 408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  48.91 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  49.28 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  47.1 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  49.04 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  48.56 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  46.53 
 
 		 409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  45.43 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 		 409 aa  330  4e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  42.42 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  42.93 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 		 408 aa  296  3e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  38.81 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  39.95 
 
 		 408 aa  276  6e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  38.68 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  40 
 
 		 408 aa  272  8.000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.44 
 
 		 650 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  39.6 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.44 
 
 		 646 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  38.77 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  39.08 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  38.65 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  38.41 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  38 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  38.82 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  36.79 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  37.13 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  38.65 
 
 		 397 aa  237  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  37.83 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  36.12 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  37.47 
 
 		 407 aa  235  9e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  38.76 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  38.57 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  38.39 
 
 		 400 aa  232  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  35.4 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  35.96 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  35.12 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  37.86 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  38.3 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  37.89 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  37.89 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  39.52 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  36.84 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  35.14 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.25 
 
 		 655 aa  229  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  38.59 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  36.87 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  36.21 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  38.19 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  37.41 
 
 		 400 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  37.04 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  36.86 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  37.41 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  37.28 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  37.19 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  37.04 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  36.79 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  36.39 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  36.79 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  36.79 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  37.04 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  37.17 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  36.79 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  38.44 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  37.35 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  37.26 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  36.65 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  35.45 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  37.5 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  37.77 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  36.95 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  37.71 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  37.2 
 
 		 402 aa  223  6e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  35.49 
 
 		 402 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  36.88 
 
 		 392 aa  222  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  35.21 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  36.54 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  37.5 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  36.23 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  35.99 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  34.96 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  35.42 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  35.11 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  35.63 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>