More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0290 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
388 aa  772    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  68.56 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  66.49 
 
 
407 aa  541  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  67.27 
 
 
405 aa  542  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  61.5 
 
 
408 aa  498  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 
412 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  49.61 
 
 
404 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  48.45 
 
 
413 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  44.76 
 
 
413 aa  361  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 
414 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  47.69 
 
 
414 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  46.92 
 
 
414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  48.71 
 
 
408 aa  347  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  43.83 
 
 
419 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  47.66 
 
 
404 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  44.78 
 
 
409 aa  332  5e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  42.78 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  42.67 
 
 
409 aa  293  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  39.02 
 
 
412 aa  292  9e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  39.53 
 
 
415 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  40.56 
 
 
408 aa  282  8.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  40.26 
 
 
408 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 
411 aa  277  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  38.5 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.41 
 
 
650 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  39.54 
 
 
408 aa  263  4e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  42.03 
 
 
407 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  40.15 
 
 
402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  40.82 
 
 
393 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.03 
 
 
646 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  40.55 
 
 
399 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  40.55 
 
 
399 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  39.69 
 
 
396 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  39.34 
 
 
394 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  38.52 
 
 
392 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  41.27 
 
 
389 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  39.44 
 
 
394 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  40.31 
 
 
397 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  39.95 
 
 
393 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  39.8 
 
 
402 aa  245  8e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  40.26 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
395 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  38.56 
 
 
400 aa  242  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  38.11 
 
 
394 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  39.95 
 
 
396 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  38.83 
 
 
394 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  39.59 
 
 
407 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  37.34 
 
 
396 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  37.28 
 
 
396 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  37.34 
 
 
396 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  36.9 
 
 
394 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  37.97 
 
 
443 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  36.9 
 
 
394 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  39.39 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  36.64 
 
 
394 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  36.9 
 
 
394 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  36.64 
 
 
394 aa  235  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  36.64 
 
 
394 aa  235  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  36.64 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  36.64 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  36.64 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  36.64 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  38.72 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  38 
 
 
401 aa  233  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  38.48 
 
 
395 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  38.89 
 
 
397 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  39.03 
 
 
393 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  38.82 
 
 
395 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  36.39 
 
 
394 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.06 
 
 
655 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  39.04 
 
 
399 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  38.38 
 
 
396 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  38.38 
 
 
396 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  39.39 
 
 
397 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  38.68 
 
 
403 aa  229  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  37.06 
 
 
399 aa  229  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  38.04 
 
 
394 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  35.62 
 
 
397 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  40.51 
 
 
402 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
394 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  36.02 
 
 
402 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  37.5 
 
 
401 aa  226  7e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  36.39 
 
 
395 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  38.07 
 
 
389 aa  225  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  35.62 
 
 
397 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  37.88 
 
 
394 aa  225  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  35.84 
 
 
400 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  37.66 
 
 
407 aa  225  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  37.94 
 
 
400 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  37.85 
 
 
394 aa  223  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  39.34 
 
 
395 aa  222  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  36.93 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  37.63 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  37.16 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  38.32 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  35.35 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  39.25 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 
397 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  38.85 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>