More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2342 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
404 aa  813    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  70.15 
 
 
407 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  64.6 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  68.56 
 
 
388 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  61.6 
 
 
408 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 
412 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  47.09 
 
 
404 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  46.95 
 
 
413 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  48.05 
 
 
414 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  46.81 
 
 
414 aa  366  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  47.55 
 
 
414 aa  363  3e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  47.32 
 
 
414 aa  358  8e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  45.16 
 
 
409 aa  358  8e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  44.66 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  42.68 
 
 
413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  46.37 
 
 
404 aa  334  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 
408 aa  333  4e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  39.9 
 
 
409 aa  293  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  37.72 
 
 
412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  37.72 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  37.12 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  37.22 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  37.9 
 
 
408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  37.93 
 
 
411 aa  267  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  37.82 
 
 
408 aa  263  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  36.23 
 
 
408 aa  250  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.53 
 
 
650 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.21 
 
 
646 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  37.99 
 
 
396 aa  242  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  38.61 
 
 
397 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 
393 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  36.08 
 
 
394 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  37.16 
 
 
393 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  37.81 
 
 
396 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  36.79 
 
 
392 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  36.75 
 
 
402 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  38.52 
 
 
407 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  37.99 
 
 
407 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  38.82 
 
 
393 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
401 aa  230  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  35.15 
 
 
396 aa  229  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  38.93 
 
 
399 aa  229  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  35.82 
 
 
396 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  35.47 
 
 
443 aa  229  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  35.82 
 
 
396 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  35.19 
 
 
397 aa  228  1e-58  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  36.12 
 
 
394 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  35.77 
 
 
400 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  35.64 
 
 
393 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  36.65 
 
 
395 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  35.96 
 
 
389 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 
401 aa  225  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  35.22 
 
 
403 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  36.61 
 
 
394 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  36.01 
 
 
394 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  35.19 
 
 
400 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  36.74 
 
 
407 aa  225  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  35.89 
 
 
395 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  33.09 
 
 
397 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  36.65 
 
 
397 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 
402 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  38.22 
 
 
397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  35.73 
 
 
395 aa  222  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  36.52 
 
 
393 aa  222  9e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  35.22 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  37.06 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  36.5 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  35.22 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 
394 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  36.5 
 
 
399 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  35.44 
 
 
399 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  35.22 
 
 
394 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 
394 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  36.86 
 
 
397 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  36.21 
 
 
389 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 
394 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  35.22 
 
 
394 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 
394 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  38.44 
 
 
400 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  38.11 
 
 
399 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  32.6 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  35.05 
 
 
402 aa  216  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  35.44 
 
 
405 aa  216  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.77 
 
 
655 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.08 
 
 
687 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  34.86 
 
 
401 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  35.52 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  35.7 
 
 
400 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  36.88 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  35.21 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  35.21 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  36.08 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  36.36 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  37.13 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  32.6 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>