38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2189 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 418 aa  847    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  61.82 
 
 		 388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  50.83 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  47.37 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  47.73 
 
 		 395 aa  343  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  46.19 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  41.55 
 
 		 369 aa  302  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  43.11 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  37.28 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  39.1 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  37.89 
 
 		 410 aa  243  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  36.38 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  37.21 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  37.47 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  33.26 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  35.78 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  39.89 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  40.59 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 322 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  22.68 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 336 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  23.81 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 317 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 344 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 688 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  25 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  21.34 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  20.74 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  21.32 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  20.51 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2246  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  24.61 
 
 		 346 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>