35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4408 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 388 aa  787    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  61.1 
 
 		 418 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  49 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  50.98 
 
 		 395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  48.08 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  49.1 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  48.15 
 
 		 369 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  42.93 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  42.51 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  39.34 
 
 		 410 aa  253  6e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  37.12 
 
 		 428 aa  226  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  36.19 
 
 		 432 aa  222  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  38.59 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  35.38 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  34.25 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  37.92 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  36.56 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  57.78 
 
 		 176 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  24.66 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 332 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  19.74 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 338 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  22.29 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  21.28 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  22.87 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  21.45 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  27.59 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  20.56 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  23 
 
 		 327 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>