22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0541 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  842    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  65.86 
 
 
432 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  60.3 
 
 
394 aa  508  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  49.27 
 
 
405 aa  363  3e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  51.44 
 
 
395 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  43.03 
 
 
428 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  35.28 
 
 
396 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  35.29 
 
 
422 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  36.45 
 
 
418 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  38.66 
 
 
410 aa  222  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  36.72 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  36.39 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  35.85 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  34.98 
 
 
393 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  34.86 
 
 
369 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  36.72 
 
 
377 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.56 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  37.27 
 
 
176 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  24.92 
 
 
335 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.92 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  22.64 
 
 
338 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>