21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3338 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  100 
 
 
393 aa  807    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  64.47 
 
 
396 aa  531  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  46.06 
 
 
418 aa  364  1e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  47.64 
 
 
388 aa  349  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  46.37 
 
 
395 aa  347  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  47.67 
 
 
377 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  39.84 
 
 
369 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  37.73 
 
 
377 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  37.07 
 
 
405 aa  229  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.94 
 
 
395 aa  222  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  34.13 
 
 
410 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  36.54 
 
 
394 aa  215  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  36.03 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  34.98 
 
 
415 aa  210  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  33.95 
 
 
432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  31.57 
 
 
422 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  33.41 
 
 
419 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  44.44 
 
 
176 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  22.26 
 
 
355 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  23.88 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  20.74 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>