21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4409 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  808    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  60.3 
 
 
415 aa  508  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  56.74 
 
 
432 aa  487  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  48.6 
 
 
405 aa  339  5e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  44.5 
 
 
428 aa  325  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  47.94 
 
 
395 aa  319  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  42.89 
 
 
388 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  36.74 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.17 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  41.28 
 
 
377 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  36.05 
 
 
393 aa  210  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.35 
 
 
369 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  33.64 
 
 
422 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  33.89 
 
 
419 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  34.52 
 
 
410 aa  182  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  34.3 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  32.07 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  38.75 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  35.79 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  30.73 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>