28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2190 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  100 
 
 
432 aa  873    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  65.62 
 
 
415 aa  548  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  58.21 
 
 
394 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  44.47 
 
 
405 aa  338  8e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  42.96 
 
 
428 aa  323  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  47.56 
 
 
395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  39.1 
 
 
418 aa  237  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  35.16 
 
 
396 aa  220  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  36.07 
 
 
388 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  35.59 
 
 
419 aa  217  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  34.01 
 
 
422 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  35.12 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  35.37 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  35.48 
 
 
410 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  33.98 
 
 
369 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  32.49 
 
 
395 aa  176  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.92 
 
 
377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  41.05 
 
 
176 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  24.57 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  22.73 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  25.16 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  25.64 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  27.37 
 
 
689 aa  44.3  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  30.65 
 
 
324 aa  43.9  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
396 aa  43.1  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  21.79 
 
 
342 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.37 
 
 
372 aa  43.1  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1836  periplasmic binding protein  25.1 
 
 
297 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>