32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3383 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  100 
 
 
396 aa  817    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  64.38 
 
 
393 aa  529  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  49.06 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  49.61 
 
 
388 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  46.43 
 
 
395 aa  333  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  47.97 
 
 
377 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  40.52 
 
 
369 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  40.48 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  38.33 
 
 
405 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  36.95 
 
 
377 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  35.84 
 
 
432 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  35.28 
 
 
415 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  35.93 
 
 
422 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  34.39 
 
 
428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.87 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  36.74 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  36.22 
 
 
419 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  48.15 
 
 
176 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
355 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  22.48 
 
 
336 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  20.65 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.047072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  21.54 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  21.59 
 
 
338 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2058  periplasmic binding protein  21.15 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158204  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  19.88 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  21.97 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
346 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2706  periplasmic binding protein  26.8 
 
 
356 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0705  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  21.17 
 
 
344 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.132797  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0756  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  21.17 
 
 
344 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.648016  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  20.51 
 
 
336 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3256  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  21.56 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>