24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0780 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
369 aa  744    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  48.64 
 
 
388 aa  332  8e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  41.16 
 
 
418 aa  299  6e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  40.26 
 
 
396 aa  296  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  39.84 
 
 
393 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  40.26 
 
 
395 aa  262  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  42.65 
 
 
377 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  39.69 
 
 
395 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  38.67 
 
 
377 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  37.29 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  34.86 
 
 
415 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  34.57 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  35.35 
 
 
394 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  33.8 
 
 
428 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  32 
 
 
432 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  30.7 
 
 
422 aa  172  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  33.01 
 
 
419 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  63.89 
 
 
176 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.84 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
342 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  24.69 
 
 
311 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  23.87 
 
 
723 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  20.06 
 
 
336 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.047072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>