26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0782 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0782  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
395 aa  807    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0394  ferrichrome-binding protein  54.86 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  0.0546977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0541  hypothetical protein  51.58 
 
 
415 aa  329  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0649388  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4409  hypothetical protein  49.23 
 
 
394 aa  328  9e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0537  ferrichrome-binding protein  45.73 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2190  ferrichrome-binding protein  47.56 
 
 
432 aa  311  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0780  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  39.69 
 
 
369 aa  236  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3338  ferrichrome-binding protein  35.94 
 
 
393 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4411  hypothetical protein  40.59 
 
 
377 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3383  ferrichrome-binding protein  35.87 
 
 
396 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4408  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  38.7 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2189  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.28 
 
 
418 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0396  ferrichrome-binding protein  35.17 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0579351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2711  hypothetical protein  36.01 
 
 
410 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3310  hypothetical protein  33.49 
 
 
419 aa  179  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.430499  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2440  hypothetical protein  29.77 
 
 
422 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00184061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0306  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.79 
 
 
377 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  22.96 
 
 
336 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  24.25 
 
 
338 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  24.81 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  23.26 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  27.87 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3312  hypothetical protein  37.18 
 
 
176 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.24 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>