More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3921 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3921  ABC-3 protein  100 
 
 		 296 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1537  ABC-3 protein  41.8 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.594974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1532  ABC-3 protein  41.54 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1627  ABC-3 protein  42.21 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2337  ABCMn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  41.83 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.48 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  26.29 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  29.2 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  29.2 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  29.2 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  29.2 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  29.2 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  28.03 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  30.13 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  28.8 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  28.8 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  28.8 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  28.8 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  28.8 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  28.8 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  28.8 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  25.98 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  27.02 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  27.02 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  27.88 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.17 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  30.96 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  29.69 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  29.81 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  30.53 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  25.28 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  30 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  27.91 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  29.84 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  29.84 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  28.76 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  30.11 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  22.69 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  27.47 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  29.44 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  26.86 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  26.1 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  24.4 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.93 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  24.03 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  31.15 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  24.03 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.02 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  29.6 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  28.72 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  32.9 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  29.25 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  30 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.02 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  23.17 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.02 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.02 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  31.9 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  25.43 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  28.72 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  28.83 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  27.54 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  27.98 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  29.23 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  27.98 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  27.98 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  30.24 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  25.79 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  28.51 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  30.24 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  25.59 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  28.24 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  22.14 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  32.89 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  30.24 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  25.85 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  29.13 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  31.07 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  27.21 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  27.21 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  29.53 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  20.08 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  28.57 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  31.35 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  27.89 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>